El Instituto ejerce sus funciones en el marco del auxilio y soporte técnico a la administración de justicia, relacionado con la medicina legal y las ciencias forenses a nivel nacional, así pues, para el óptimo desarrollo de la misión institucional es indispensable la correcta ejecución de la función pública al interior de la entidad y en especial de la gestión contractual.

De acuerdo a lo anterior, la Secretaria General tiene a su cargo tres (3) grandes procesos transversales que son:

1. Oficina de Personal: A través de la misma se encarga del manejo del talento humano de los servidores públicos vinculados a la entidad, velando por el cumplimiento de la ley y la protección a los derechos laborales fundamentales de los mismos.
2. Grupo Nacional de Gestión Contractual: La función desempeñada a través del Grupo consiste en la adquisición de bienes y servicios que propenden por la mejora continúa del servicio prestado por el Instituto, cumpliendo los principios de la gestión pública.
3. Grupo Nacional de Gestión de la Seguridad y Salud en el Trabajo y Medio Ambiente: Por medio del GNGSSTMA se establecen los lineamientos de gestión de la seguridad y salud en el trabajo y medio ambiente para los servidores públicos y contratistas del Instituto.

El reflejo de la eficacia y eficiencia de una institución radica en que sus servidores cuenten con garantías institucionales legales y reglamentarias que le permitan gozar de sus derechos laborales con amplitud y responsabilidad, siendo importante la labor ejercida desde Secretaria General, la cual, a través de sus grupos otorga incentivos especiales a los servidores públicos que así lo requieran, cumpliendo entre otras funciones las siguientes:

1. Vigilar el cumplimiento de las normas legales en desarrollo de las actividades administrativas y forenses del Instituto.
2. Generar políticas relacionadas con la administración de talento humano, bienestar social, salud ocupacional, medio ambiente, higiene y seguridad industrial del Instituto.
3. Diseñar planes y programas de desarrollo humano tendientes a garantizar un ambiente laboral adecuado.
4. Asesorar, dirigir y coordinar la carrera administrativa del Instituto.

Para el Instituto Nacional de Medicina Legal y Ciencias Forenses es fundamental el cuidado y protección de los servidores públicos que se encuentran vinculados a la institución, garantizando igualmente por parte de Secretaria General el seguimiento de la recuperación de la salud a través de mesas de trabajo en aquellos casos en los cuales el funcionario hubiese visto un detrimento en su salud permitiéndole así un restablecimiento en sus derechos y calidad de vida.

Así mismo, Secretaria General como ordenadora del gasto (ver imagen II) desempeña una función vital desde el marco de la contratación estatal, a través de la realización de todos los procesos contractuales a nivel nacional que benefician al Instituto, los cuales se surten bajo la garantía de los principios constitucionales y contractuales.

Finalmente, es pertinente considerar la misma como una puerta institucional, ya que a través de Secretaria General se garantiza que los engranajes más importantes del inmenso reloj institucional cumplan con la misión de la entidad.